Marseille, 18ème siècle. Le « Grand Saint-Antoine », un navire marchand, a ramené à Marseille des étoffes infectées d’un mal mystérieux et mortel. Alors que l’épidémie menace, on se refuse encore à admettre en haut lieu qu’il puisse s’agir de la peste. La cargaison infectée n’a pas été détruite et seul Mathieu Gensoul tente d’empêcher des contrebandiers sans scrupules de vendre ces étoffes à travers le pays. Mais que peut un simple chirurgien quand tous se liguent contre lui ?