Alex Flemming se croyait un élève sans histoire. Mais en l’espace de quelques jours, il découvre qu’il dispose d’étranges facultés, qu’il est un agent dormant rôdé aux méthodes d’investigations et aux techniques de combat, que son père est un ancien espion lui-même, et que toute sa famille trempe dans l’univers des barbouzes. L’ombre se sa mère disparue plane alors en long et en large, et sa vie de famille s’en ressent. D’autant que tout le monde semble avoir ses petits secrets. Comme si Spyboy n’avait pas assez d’ennuis comme ça, Bombshell, l’explosive espionne qui l’accompagne dans toutes ses missions, vient d’être enlevée. Spyboy s’envole alors pour un périple qui l’emmenera à l’autre bout du monde, à la renconte de Spygirl !