Une page s’est tournée sur l’Area D. Ce n’est plus une prison placée sous le contrôle de la communauté internationale, mais le bastion de la rébellion des altered. C’est, semble-t-il, Jin Kazaragi qui a pris le contrôle de l’île et déclaré la guerre au monde entier. Après avoir coulé toute la flotte lancée à son assaut, l’île ordonne aux autorités de la communauté internationale de continuer à lui envoyer des altered.